自宅が遠方にあり通学が困難な生徒のために寄宿舎があります。また、基本的な生活習慣の自立や社会性を経験することで卒業後の自立を育成する場でもあります。

　清笛寮では規則正しい生活を送ることを基本とし、1室に3～4名1フロア25～35名で共同生活をしています。日常生活では主に洗濯や掃除をはじめとする基本的生活習慣の確立、向上を目指して取り組んでいます。

　舎友会活動（自治活動）を通し、寄宿舎生活を自分たちで作る取り組みを行っています。（行事企画、ルール改善など）